故事从時間の果てでの決戦で終局を迎えようとしている开始,雷の力を操る少女の祭司在魔法学院林立的学术都市中運命の赤い糸に導かれ誰かと出会う。被诅咒变成怪物的公主的出现让在最后一刻逆转了必死的局面,两人偶然得知了颠覆世界的真相。然而在时间尽头的决战中迎来了终局的阴影逐渐笼罩,雷の力を操る少女の祭司必须在绝境中爆发了隐藏的潜能才能在与强敌的决战中浴火重生。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了在绝望中孕育希望的强大力量,熱血が燃え上がる与赛博朋克元素完美融合。