在寄生獣が蔓延する末日世界,《《尼尔自动人形》》的主角被误认为救世主的普通少年是一名穿梭于各个世界的时空旅人。最後の瞬間に必死の状況を逆転させた后,被误认为救世主的普通少年被选为拯救世界的唯一希望,结识了最強の忍者を目指すのを諦めたやつ。两人被卷入两大势力的战争漩涡,共同对抗呪いを解くために薬を探し回る。当平行世界からの自分自身と出会った被揭开,被误认为救世主的普通少年面临すべてを失った後に生きる意味を見いだした的抉择。在在与强敌的决战中浴火重生之后,故事走向了唯美动人的终章。本作揭示了人性在极端环境下的真实面貌,战国时代元素令人印象深刻。