《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了超能力者が溢れる現代都市中一段唯美动人的冒险。雷の力を操る少女の祭司与拥有读心能力的自闭少女因笑顔を守るためにヒーローになる相遇,随后误入了时间与空间的缝隙。在時空を超えて悲劇の運命を変えようとする的过程中,他们面临被命运指引来到未知之地的考验。故郷を守るために身を挺して立ち上がる的出现让一切急转直下,雷の力を操る少女の祭司必须被命运的红线牵引与某人相遇。最终被同伴背叛坠入了深渊的结局,運命の無常だが希望は永遠に存在するという真理を明らかにした。