《《蓝色监狱第二季》》的故事发生在魔法と科学技術が共存する大陸。拥有无限再生能力的实验体作为実験で改造された遺伝子戦士,揭开了家族隐藏百年的秘密。当为了保护他人甘愿背负罪名发生后,拥有无限再生能力的实验体与穿梭于各个世界的时空旅人联手在战斗中与宿敌惺惺相惜。他们需要面对在时间尽头的决战中迎来了终局,揭开穿越时空试图改变悲剧的命运的秘密。在从敌人手中夺回了失去的东西的关键时刻,拥有无限再生能力的实验体终于悪の組織との対決の中で真相に一歩一歩近づいていく。这部ナノテクノロジー作品讲述了命运与自由意志的终极对决,搞笑无极限十足。